Taxonomische Referenzliste der Gefäßpflanzen Bayerns
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Inhaltsverzeichnis
- 1 Definition und Ziel der taxonomischen Referenzliste der Gefäßpflanzen Bayerns
- 2 Summary
- 3 Beschreibung des Inhalts, Stand März 2023
- 4 Taxonomische Referenz und Datenaustausch
- 5 Datenpflege und -bereitstellung
- 6 Zitiervorschläge
- 7 Datenfluss, Importe, Integration in Applikationen
- 8 Datenaustausch zur Pflege des Artencodeplans des Bayerischen Landesamt für Umwelt (LfU)
- 9 Informationsquellen
Herunterladen der Taxonomischen Referenzliste als:
- 18px Excel-Tabelle (Stand März 2023) zum Herunterladen
- 20px dbase-Datei (Stand März 2023) (für FlorEin)
→ weitere Möglichkeiten der Nutzung siehe unter Datenpflege und -bereitstellung.
Definition und Ziel der taxonomischen Referenzliste der Gefäßpflanzen Bayerns
Taxon bezeichnet in der Biologie eine als systematische Einheit erkannte Gruppe von Lebewesen und ist gleichbedeutend mit Sippe; Taxon/Sippe kann eine Art meinen, aber auch eine Unterart, eine Gattung oder auch jede höhere verwandtschaftliche Einheit, die gerade betrachtet wird. Verschiedene Taxa werden in ihrer Verwandtschaft zueinander klassifiziert. Die Taxonomie als ein Teilgebiet der Biologie erfasst die verwandtschaftlichen Beziehungen von Lebewesen in einer Systematik. Taxonomien (und Phylogenien) sind Gegenstand der Forschung. Taxonomische Konzepte und Klassifikationen ändern sich daher laufend.
Um jedoch ein stabiles Arbeitsgerüst für darauf aufbauende Forschungen wie Kartierungsprojekte und Beobachtungen zu Fauna und Flora zu haben, sind globale wie regionale Taxonomische Standardreferenzlisten wichtig. Sie bilden frühere und aktuelle Taxonkonzepte und Klassifikationen ab, Beziehungen von Taxa und Konzepten zueinander, und übersetzen diese in akzeptierte Konzepte und Namen.
Die digital kuratierte Taxonomische Referenzliste der Gefäßpflanzen Bayerns hat in dieser Kernfunktion die Aufgabe einer Namens- und Klassifikationsliste und Liste zur Registrierung von Namenseinheiten und Identifizierung derselben mittels stabiler, eindeutiger und dauerhaft verfügbarer IDs. Sie kann damit für verschiedenste Funktionen genutzt und ausgebaut werden. Die Referenzliste mit ihren TaxRef IDs organisiert u. a. die Artensteckbriefe im BIB Datenportal und liegt dem Aufbau der kommentierten Artenliste oder Checkliste zugrunde (s. Lippert & Meierott 2014, Lippert & Meierott 2018). Regionalisierte Taxonomische Referenzlisten werden in ihrer Grundfunktion für ein Gebiet digital fortgeschrieben.
Die Taxonomische Referenzliste der Gefäßpflanzen Bayerns leistet entsprechende Dienste auch für die geplante gedruckte Flora von Bayern. Sie wird nach den Vorstellungen der Pflanzenkenner und Taxonomen in Bayern weiter langfristig gepflegt und stellt das Rückgrat für Kommunikation und jeglichen Datenaustausch dar. Die Kuration der Daten in einer SQL-Datenbank wird derzeit unterstützt durch das Bayerische Landesamt für Umwelt und die Staatlichen Naturwissenschaftlichen Sammlungen Bayerns im Rahmen des Projektes Koordinationsstelle Bayernflora. Teile des Datenflusses werden in Novotný et al. (2022) beschrieben.
Summary
The "Taxon list of the vascular plants of Bavaria, Germany, compiled in the context of the BFL project (list code: TaxRef_BFL_VPlants)" is the regional standard reference list for vascular plants, i. e. flowering plants and ferns, in Bavaria.
It is recognized as such by governmental organisations and NGOs in Bavaria. The list curation is a long-term effort and currently supported by the the Bavarian Environment Agency and the Bavarian State Collections in the context of the project Koordinationsstelle Bayernflora. Starting with 2016 the list curator is Wolfgang Diewald, München. He should be contacted in case of additions and emendments.
The list includes 14,064 scientific names (9,067 of these accepted and 4,997 synonyms) as well as 8,255 common names in German and a higher classification up to the devision "Tracheophyta" (status for March, 2023).
The content of the list is offered under Creative Common License CC BY 4.0. For details about technical services click Datenpflege und -bereitstellung and DTN Taxon Lists Services. For resources and references click Quellen.
The taxa of the TaxRef_BFL_VPlants are assigned to taxon attributes from the Bavarian Environment Agency, to attributes from European or National Nature Conservation Agencies as well as to descriptors recognized by the scientific communities like functional traits and biological parameters. This content is currently under review and improuvement and not offered for download.
Beschreibung des Inhalts, Stand März 2023
Die Taxonomische Referenzliste der Gefäßpflanzen Bayerns "TaxRefBayern" enthält mit Stand März 2023 insgesamt 14.064 wissenschaftliche Namen (davon 9.067 akzeptierte Namen und 4.997 Synonyme) sowie 8.255 deutsche Namen. Der Datenbestand wird seit Mai 2015 in DiversityTaxonNames gepflegt (s.u.).
Die gelisteten Namen umfassen die für Bayern gemeldeten:
- einheimischen, eingebürgerten und unbeständigen Arten
- Unterarten und Varietäten
- Artengruppen (Aggregate) bestimmungskritischer Kleinarten
- höheren Taxa bis "Gefäßpflanzen"
- Hybriden
- Zweifelhafte und Falschmeldungen (als solche gekennzeichnet)
- Synonyme (soweit in den Datenbeständen bisher verwendet; konsequenter ab Vollmann 1914)
Taxonomische Referenz und Datenaustausch
Die Taxonomische Referenzliste der Gefäßpflanzen Bayerns liefert das Bezugssystem zum Datenaustausch zwischen unterschiedlichen Datenquellen, seien es Datenbanken mit Beobachtungsdaten für einzelne Arten, mit Herbardaten, Literaturdaten, mit Merkmalsdaten und ökologischen Zeigerwerten sowie taxonomischen Datenbanken mit abweichenden nomenklatorischen Synonymie- und taxonomischen Konzept-Beziehungen.
Die Taxonomische Referenznummer (kurz taxnr) im Flora von Bayern-Kontext ist dabei die eindeutige Identifikationsnummer eines Pflanzennamens in einer bestimmten Bedeutung. Das System der "taxnr" wurde mit Beginn der digitalen Datenverarbeitung zu den Floristischen Kartierungen in Deutschland eingeführt und erlaubt seitdem das konsistente Management taxonomischer Namensbestände und ihrer komplexen Beziehungen zueinander.
Eine taxnr wird auf sämtlichen taxonomischen Ebenen vergeben, auch unterhalb und oberhalb der Artebene; hierarchisch aufwärts bis zur Abteilung "Tracheophyta" (=Gefäßpflanzen) und abwärts bis zur Varietät und Form. In den weit verbreiteten Erfassungsprogrammen der Floristischen Kartierung wie Recorder 6D und FlorEin wird diese taxnr als Code für den Namen abgespeichert. In der Taxonomischen Referenzliste der Gefäßpflanzen Bayerns selbst wird dokumentiert, was unter einer bestimmten taxnr zu verstehen ist und welche Beziehungen zu anderen Taxa bestehen. Gleichlautende Namen erhalten unterschiedliche taxnr, sobald sie unterschiedliche Bedeutungen haben. Der Bedeutungsumfang wird z. T. mit Zusätzen wie "s. l." (sensu lato; im weiteren Sinne), "s. str." (sensu stricto; im engeren Sinne) oder auch "sensu Ehrendorfer" (im Sinne von Ehrendorfer 1973) oder "agg." (Aggregat; Gruppe von einander sehr ähnlichen Arten) dargestellt. (Details dazu auch bei Ahlmer 2015: Die bayerische Taxonomische Referenzliste, Vortrag gehalten auf dem 5. Tag der Bayernflora und bei Lippert & Meierott 2014, S. 5).
Die Taxonomischen Referenznummern zur Flora von Bayern werden abgeglichen mit denen der Flora von Deutschland, so dass ein Datenaustausch wie anlässlich der Erstellung des Verbreitungsatlas der Farn- und Blütenpflanzen Deutschlands möglich ist. Zudem sind sie verbunden mit den Code-Nummern des Bayerischen Landesamtes für Umwelt, was die Verknüpfung dieser beiden großen Ressourcen bayerischer Verbreitungsdaten ermöglicht. Nur so kann z. B. die Rote Liste der gefährdeten Gefäßpflanzen Bayerns erstellt werden.
Datenpflege und -bereitstellung
Von 2002 bis 2015 wurde die Taxonomische Referenzliste der Gefäßpflanzen Bayerns als MS Access-Datenbank vom Listenkurator Wolfgang Ahlmer geführt. 2015 wurde sie zur weiteren nachhaltigen Datenkuration in DiversityTaxonNames überführt, eine MS SQL-Server Datenbank der Diversity Workbench (=DWB)-Plattform. Dies macht nun erstmals ein langfristiges Datenmanagement mit zentraler Datenhaltung kombiniert mit verteilter, dezentraler Datenpflege über DWB Schnittstellen möglich. Umfangreiche Werkzeuge erlauben Datenkuration, Importe und (Teil-)Exporte und erleichtern den Datenaustausch, z. B. über Webservices und Exportroutinen. Seit dem Import in DiversityTaxonNames wird auch die Taxonomische Referenznummer dort gepflegt. Auf Anfrage erhalten Mitarbeiter der Flora von Bayern lesenden Zugriff über einen DWB Account und lokalen .Net Client. Die eigentliche Datenpflege erfolgt ab 2016 durch Wolfgang Diewald, datentechnisch unterstützt von Mitarbeitern des SNSB IT-Zentrums.
Die Taxonomische Referenzliste der Gefäßpflanzen Bayerns steht über verschiedene Dienste und in verschiedenen Formaten bereit:
- 18px Excel-Tabelle (Stand März 2023) zum Herunterladen
- 20px dbase-Datei (Stand März 2023) zum Herunterladen (für Nutzer von FlorEin) →
Anleitung zum Einbinden der bayerischen Taxonomischen Referenzliste in das Programm FlorEin
- 18px Excel-Tabelle (Stand Januar 2019) zum Herunterladen
- 20px dbase-Datei (Stand Januar 2019) zum Herunterladen (für Nutzer von FlorEin) → Anleitung zum Einbinden der bayerischen Taxonomischen Referenzliste in das Programm FlorEin
- 20px dbase-Datei (Stand August 2015) zum Herunterladen (für Nutzer von FlorWin) → Anleitung zum Einbinden der bayerischen Taxonomischen Referenzliste in das Programm FlorWin
- 24px.dic-Dateien (Stand 2016) zum Herunterladen (für Nutzer der Rechtschreibprüfung in MS Word) → Anleitung zum Integrieren in das Word Rechtschreibwörterbuch
- Für das Bayerische Landesamt für Umwelt und das Bundesamt für Naturschutz werden Exportroutinen bereitgestellt (im Aufbau)
Die Liste ist unter Beachtung der Creative Common License CC BY 4.0 zu verwenden.
Frühere Versionen:
- 18px Excel-Tabelle (Stand Januar 2019) zum Herunterladen
- 18px Excel-Tabelle (Stand August 2015) zum Herunterladen
- 18px Excel-Tabelle (Stand 2014) zum Herunterladen
- 18px Excel-Tabelle (Stand 2009) zum Herunterladen
- 18px Excel-Tabelle (Stand 2003) zum Herunterladen
Zitiervorschläge
Zitiervorschläge, je nach genutztem Service (--> Inhalt basiert v. a. auf den zitierten Informationsquellen):
Ahlmer, W. (2015): Die Taxonomische Referenzliste der Gefäßpflanzen Bayerns (Version August 2015) als dbase-Datei und Excel-Tabelle zum Herunterladen. – Heruntergeladen von https://www.bayernflora.de/web/Taxonomische_Referenzliste_der_Gef%C3%A4%C3%9Fpflanzen_Bayerns#Datenpflege_und_-bereitstellung am YYYY-MM-DD.
Diewald, W. & Ahlmer, W. (2019): Die Taxonomische Referenzliste der Gefäßpflanzen Bayerns (Version Januar 2019) als Excel-Tabelle zum Herunterladen. – Heruntergeladen von https://www.bayernflora.de/web/Taxonomische_Referenzliste_der_Gef%C3%A4%C3%9Fpflanzen_Bayerns#Datenpflege_und_-bereitstellung am YYYY-MM-DD.
Diewald, W. & Ahlmer, W. (2023): Die Taxonomische Referenzliste der Gefäßpflanzen Bayerns (Version März 2023) als Excel-Tabelle zum Herunterladen. – Heruntergeladen von https://www.bayernflora.de/web/Taxonomische_Referenzliste_der_Gef%C3%A4%C3%9Fpflanzen_Bayerns#Datenpflege_und_-bereitstellung am YYYY-MM-DD.
Diewald, W. & Ahlmer, W. (2016 onwards). Taxon list of vascular plants from Bavaria, Germany compiled in the context of the BFL project. DWB REST Webservice for Taxon Lists. – Accessed via http://services.snsb.info/DTNtaxonlists/rest/v0.1/static/api-doc.html on YYYY-MM-DD.
Diewald, W. & Ahlmer, W. Taxon list of vascular plants from Bavaria, Germany compiled in the context of the BFL project. Staatliche Naturwissenschaftliche Sammlungen Bayerns. Checklist dataset https://doi.org/10.15468/nbilcw accessed via GBIF.org on YYYY-MM-DD.
(oder Diewald, W. & Ahlmer, W. (2016 onwards). Taxon list of vascular plants from Bavaria, Germany compiled in the context of the BFL project. – Accessed via https://doi.org/10.15468/nbilcw on YYYY-MM-DD. Data publisher: Staatliche Naturwissenschaftliche Sammlungen Bayerns)
Datenfluss, Importe, Integration in Applikationen
Der Datenfluss für Namen, wissenschaftliche Namenskonzepte und namens- und taxon-bezogene Attribute, naturschutzrelevante Bewertungskategorien, Zeigerwerte und Statusinformationen im Kontext der Flora von Bayern wird demnächst hier als Graphik dargestellt.
Importe von neuen Namen unter Vergabe von neuen taxnr werden regelmäßig nötig. Dies ist dem Fortschritt der Wissenschaft geschuldet und erfolgt unter Abgleich mit anderen taxonomischen Listen, v. a. mit der vom Netzwerk Phytodiversität Deutschland e. V. und dem Bundesamt für Naturschutz gepflegten Referenzliste für Deutschland. Importe von Taxon-Attributen, wie Rote-Liste- oder Schutzstatus und ökologischen Parametern erfolgen meist aufgrund von Änderungen der Naturschutzbelange und entsprechender Vorschriften und Gesetzgebungen. Häufiger jedoch wird die Taxonomische Referenzliste durch neue Namen ergänzt, wenn v. a. über regionale Kartierungen weitere Neophyten und Kulturflüchtlinge bekannt werden und wenn durch Literatur- und Herbarauswertungen die Verwendung neuer Synonyme notwendig wird (in FlorEin sind diese neuen Namen als "90.000er-Namen" bekannt, wegen der automatischen Vergabe vorläufiger taxnr über 90.000).
Die Taxonomische Referenzliste der Gefäßpflanzen Bayerns ist in den angebotenen DWB-konforme MS Excel-Vorlagen zur Eingabe von Beobachtungsdaten zur Flora von Bayern integriert sowie im Flora-von-Bayern Netzwerk aus verschiedenen DWB-Datenbanken und Installationen verfügbar. Auch die Smartphone-App DiversityMobile nutzt die Liste als Teil des DiversityMobile Taxon lists service.
Datenaustausch zur Pflege des Artencodeplans des Bayerischen Landesamt für Umwelt (LfU)
Der Artencodeplan des LfU beinhaltet neben der taxonomischen Referenz einige Zusatzattribute wie den Rote Liste-Status Bayern und Deutschland, den Status als FFH-Anhangsart usw. Sie werden in Datenbanken des LfU verwaltet und erhalten über die taxnr der Taxonomischen Referenzliste der Gefäßpflanzen Bayerns ihre zugrundeliegenden Artkonzepte. Bei geänderten Artkonzepten müssen gegebenenfalls Zusatzattribute neu zugeordnet werden.
Informationsquellen
Die Taxonomische Referenzliste der Gefäßpflanzen Bayerns basiert vor allem auf folgenden Informationsquellen und technischen Konzepten:
sowie auf den laufenden Arbeiten an den Taxonomischen Referenzlisten am Bundesamt für Naturschutz (BfN), beim Netzwerk Phytodiversität Deutschland e.V. (NetPhyD) und am SNSB IT-Zentrum.
